O Tribunal de Justiça de Santa Catarina decidiu suspender o Código Ambiental Catarinense. O TJ analisou o caso específico da comarca de Armazém. No caso concreto, o Ministério Público havia obtido liminar paralisando atividade industrial exercida em área de preservação permanente.

O empresário e a FATMA recorreram. O TJSC decidiu que "Diante da inexistência de ressalva expressa no Código Florestal quanto à possibilidade de limitação da área de preservação permanente por ele definida em área rural e diante da necessidade de se compatibilizar duas normas aplicáveis ao mesmo caso concreto, há de se empregar, pelo menos na fase processual de cognição sumária, a que melhor resguarde o meio ambiente". Na prática, a decisão abre precedente contrário às licenças ambientais concedidas pela FATMA tendo como base o Código Ambiental Catarinense.